為了實現自然通風，人們可以在溫室側墻或屋頂上設置窗戶。一般地，溫室側窗有利于增加溫室周邊的通風，但開啟面積有限。而溫室天窗的開啟面積則要大得多，且熱空氣上行，所以溫室天窗能更有效地增加整個溫室的通風能力，有利于促進整個溫室均勻降溫。

 隨著單體溫室面積的不斷擴大，對于提高溫室通風能力，天窗比側窗效果要好得多。借助開窗系統(tǒng)，溫室側窗和天窗可以根據需要開啟或關閉。溫室側窗通常為連續(xù)窗，如果溫室覆蓋了玻璃、PC板等比較堅硬的材料，則采用連續(xù)齒輪齒條系統(tǒng)驅動；如果是薄膜等軟材料，則可采用卷膜開窗系統(tǒng)。還有一個選擇是使用充氣保利窗，即通過氣囊充氣或放氣，實現保利窗的閉合和開啟。溫室天窗可以設計成沿溫室屋脊連續(xù)開啟或者斷續(xù)開啟。如果是連續(xù)天窗，則用連續(xù)齒輪齒條系統(tǒng)驅動，每個天窗使用一套連續(xù)齒輪齒條系統(tǒng)。多個連續(xù)天窗也可用分動式齒輪齒條系統(tǒng)同時啟閉，即開窗軸上的扭矩分配器與渦輪蝸桿減速器輸入軸相連，一個渦輪蝸桿減速器驅動一個天窗。當天窗材料為薄膜時，也可采用卷膜開窗系統(tǒng)；如果是斷續(xù)天窗，可從桁架式齒輪齒條系統(tǒng)、搖擺式齒輪齒條系統(tǒng)、立柱固定式齒輪齒條系統(tǒng)中任選一種驅動系統(tǒng)。其中桁架式齒輪齒條系統(tǒng)最為常見，搖擺式齒輪齒條系統(tǒng)應用很少，而立柱固定式齒輪齒條系統(tǒng)只是將桁架式齒輪齒條系統(tǒng)中驅動軸和齒輪移到了溫室天溝下面，減少了開窗系統(tǒng)對入射光的遮擋，這是開窗系統(tǒng)的一種發(fā)展趨勢。

  溫室強制通風系統(tǒng)通常采用低壓大流量軸流風機或者環(huán)流風扇。低壓大流量軸流風機主要用來向溫室內吹風，或者往溫室外抽風。往溫室外抽風可以避免氣流對溫室內植物的損害，且溫室外空氣將通過溫室各處縫隙向溫室內補充，有利于在溫室內形成一個均勻、風速適中的空氣流場，故應用要廣泛得多。環(huán)流風扇是一種較小流量的軸流風機，多用于促進溫室內空氣的流動，有利于溫室內溫度、濕度的均勻，促進植物葉面水分的蒸發(fā)。當溫室尺寸超出低壓大流量軸流風機的有效工作距離時，可將環(huán)流風扇作為接力風機使用，以確保強制通風的效果。

  比較而言，自然通風耗能少、噪音低，通風均勻，但通風能力受溫室周邊氣流、溫室內外溫差等因素影響，波動較大。強制通風要消耗大量電能，風機運行時機械噪音和風噪較大，其優(yōu)點是通風能力較強、通風時間可控。因此，如果溫室對通風要求不高，可考慮采用自然通風。反之，應采用強制通風。